肛瘘引起的原因，是由于肛门周围脓肿发生了自行溃破，或者是在进行人为切开排脓以后，遗留了管道和外口。
肛瘘是一种发生在肛管或直肠下端并与会阴皮肤相连的慢性感染性导管，主要侵犯肛管，很少侵犯直肠。由内口、瘘管和外口组成。内口通常位于齿状线附近，大部分位于齿状线附近；外口位于肛周皮肤上，可以是一个或多个；瘘管壁为增厚的纤维组织，管腔表面为肉芽组织。临床上，慢性盆腔分泌物和周期性疼痛是其特征，可以是持续性的或间歇性的。肛瘘和肛周脓肿是属于同一个疾病的两个发展过程，肛瘘一般通过肛门局部的检查，可以初步明确诊断，必要时可以进行直肠内的超声检查，或者是肛周核磁共振的检查，进一步判断肛瘘的瘘管走形，以及原发感染内口的位置。肛瘘在诊断明确以后需要通过手术进行治疗。如果是低位单纯性的肛瘘，可以直接切除原发的感染内口，肛瘘的管道部分和外口，如果是高位复杂性的肛瘘，需要采用挂线的手术方式，保护肛门括约肌，降低术后发生肛门失禁的风险。
肛瘘患者需要注意自己的饮食，避免辛辣刺激性食物和酒精的摄入，以防止便秘或腹泻引起的肛瘘急性感染，注意作息规律，防止免疫力低下引起的感染，注意肛门周围的清洁，防止外来细菌进入导致瘘管感染。虽然肛瘘患者对这些都很重视，但不能使肛瘘自我愈合，只能降低急性肛瘘发作的频率。对于肛瘘患者来说，最重要的是要及时到医院进行手术治疗，因为长期的慢性炎症刺激可能会导致肛瘘局部恶变，特别是对于有10年以上病史的肛瘘患者，恶变的概率会大大增加。
