停经原因包括疾病、器质性因素和先天因素三种。
致停经有消耗性疾病，如重度肺结核、严重贫血、营养不良等，还有内分泌疾病，如肥胖、生殖无能性营养不良病等，使肾上腺、甲关腺、胰腺的功能紊乱。这几种情况，只要疾病治好了，月经也就正常了。
器质性的因素，包括生殖道下段闭锁，如子宫颈、阴道、处女膜、阴唇等处，或先天性闭锁，或后天损伤造成粘连性闭锁，虽然有月经，但经血不能外流，这种情况称为隐性或假性闭经。这种因素经过医生治疗，是可以治愈。
先天因素。有人先天无卵巢或卵巢发育不良、颀坏，不产生雌激素和孕激素，子宫内膜不发生周期性变化，子宫内膜也就不会脱落，所以就没有月经来潮。也有人先天无子宫、子宫内膜发育不良、内膜损伤，即使卵巢功能健全，雌激素和孕激素的分泌正常，也不会来月经。
